此外，常染色质通过染色体重排被移位到异染色质区域或附近。在异染色质的影响下，会导致常染色质异染色质化，产生斑点位置效应（PEV），从而使其中的基因表达受到抑制。精细陷阱手术的常规死亡循环使一些与生殖相关的基因沉默，从而导致生殖异常。它们都会产生流产、不孕、死产等症状的临床效果，其中生殖异常占大多数。染色体多态性不仅具有临床作用，而且与生殖异常显着相关。当然，造成这些临床效应的染色体多态性除了主要考虑异染色质变异外，还可能有环境和遗传因素。

染色体多态性有一定的临床影响，主要表现为流产、死产、不孕等，占临床总影响的79.44%。但染色体多态性在分子水平上的研究还有待进一步开展，以便为临床提供更准确的依据。